Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms