Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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RAB3GAP1Q15042 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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RAB3GAP1Q15042 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3GAP1Q15042 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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