Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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CHD4Q14839 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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CHD4Q14839 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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CHD4Q14839 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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CHD4Q14839 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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CHD4Q14839 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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CHD4Q14839 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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CHD4Q14839 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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CHD4Q14839 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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