Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms