Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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