Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms