Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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