Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDH18Q13634 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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