Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PEX6Q13608 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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PEX6Q13608 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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PEX6Q13608 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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