Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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SCGB2A2Q13296 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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