Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF5Q13243 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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