Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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IFT88Q13099 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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IFT88Q13099 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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IFT88Q13099 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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IFT88Q13099 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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IFT88Q13099 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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