Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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