Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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