Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TWF1Q12792 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TWF1Q12792 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms