Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms