Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms