Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDR1Q08345 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms