Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSME1Q06323 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSME1Q06323 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms