Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms