Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMF1P82094 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMF1P82094 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMF1P82094 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMF1P82094 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMF1P82094 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMF1P82094 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMF1P82094 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMF1P82094 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMF1P82094 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMF1P82094 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMF1P82094 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMF1P82094 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMF1P82094 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMF1P82094 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMF1P82094 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMF1P82094 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMF1P82094 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMF1P82094 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMF1P82094 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMF1P82094 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMF1P82094 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMF1P82094 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMF1P82094 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMF1P82094 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMF1P82094 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMF1P82094 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMF1P82094 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMF1P82094 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMF1P82094 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMF1P82094 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMF1P82094 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMF1P82094 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMF1P82094 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMF1P82094 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMF1P82094 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMF1P82094 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMF1P82094 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMF1P82094 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMF1P82094 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMF1P82094 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMF1P82094 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMF1P82094 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMF1P82094 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMF1P82094 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMF1P82094 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMF1P82094 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMF1P82094 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMF1P82094 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMF1P82094 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMF1P82094 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMF1P82094 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMF1P82094 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMF1P82094 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMF1P82094 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMF1P82094 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMF1P82094 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMF1P82094 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMF1P82094 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMF1P82094 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMF1P82094 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMF1P82094 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMF1P82094 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMF1P82094 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMF1P82094 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMF1P82094 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMF1P82094 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMF1P82094 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMF1P82094 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMF1P82094 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMF1P82094 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMF1P82094 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMF1P82094 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMF1P82094 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMF1P82094 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMF1P82094 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms