Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UFM1P61960 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFM1P61960 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFM1P61960 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFM1P61960 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFM1P61960 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFM1P61960 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFM1P61960 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFM1P61960 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFM1P61960 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFM1P61960 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFM1P61960 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFM1P61960 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFM1P61960 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFM1P61960 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFM1P61960 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFM1P61960 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFM1P61960 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFM1P61960 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFM1P61960 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFM1P61960 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFM1P61960 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFM1P61960 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFM1P61960 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFM1P61960 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UFM1P61960 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFM1P61960 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFM1P61960 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFM1P61960 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFM1P61960 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UFM1P61960 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms