Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms