Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPS3AP61247 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms