Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2FP61218 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2FP61218 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms