Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms