Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CASP4P49662 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP4P49662 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP4P49662 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP4P49662 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP4P49662 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP4P49662 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP4P49662 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP4P49662 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP4P49662 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP4P49662 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP4P49662 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP4P49662 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP4P49662 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP4P49662 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP4P49662 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP4P49662 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP4P49662 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP4P49662 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms