Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK8P49336 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK8P49336 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK8P49336 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK8P49336 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK8P49336 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK8P49336 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK8P49336 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK8P49336 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK8P49336 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK8P49336 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK8P49336 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK8P49336 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK8P49336 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK8P49336 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK8P49336 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK8P49336 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK8P49336 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK8P49336 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK8P49336 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK8P49336 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK8P49336 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK8P49336 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK8P49336 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK8P49336 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK8P49336 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK8P49336 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK8P49336 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK8P49336 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK8P49336 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK8P49336 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK8P49336 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK8P49336 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK8P49336 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK8P49336 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms