Protein–RNA interactions for Protein: P48736

PIK3CG, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CGP48736 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CGP48736 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3CGP48736 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms