Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT6CP48668 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms