Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GRIA4P48058 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms