Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MDH1P40925 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MDH1P40925 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MDH1P40925 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MDH1P40925 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MDH1P40925 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MDH1P40925 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MDH1P40925 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MDH1P40925 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MDH1P40925 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MDH1P40925 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MDH1P40925 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MDH1P40925 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MDH1P40925 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MDH1P40925 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MDH1P40925 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MDH1P40925 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MDH1P40925 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MDH1P40925 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MDH1P40925 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MDH1P40925 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms