Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms