Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms