Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFNP31947 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFNP31947 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFNP31947 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFNP31947 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFNP31947 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFNP31947 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFNP31947 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFNP31947 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFNP31947 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFNP31947 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFNP31947 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SFNP31947 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SFNP31947 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFNP31947 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFNP31947 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFNP31947 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFNP31947 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFNP31947 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFNP31947 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFNP31947 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFNP31947 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFNP31947 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFNP31947 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFNP31947 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFNP31947 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFNP31947 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFNP31947 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFNP31947 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFNP31947 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFNP31947 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFNP31947 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFNP31947 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFNP31947 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFNP31947 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFNP31947 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFNP31947 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFNP31947 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFNP31947 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFNP31947 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFNP31947 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFNP31947 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFNP31947 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFNP31947 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFNP31947 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFNP31947 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFNP31947 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFNP31947 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFNP31947 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFNP31947 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFNP31947 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFNP31947 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFNP31947 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFNP31947 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFNP31947 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFNP31947 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFNP31947 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SFNP31947 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFNP31947 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFNP31947 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFNP31947 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFNP31947 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFNP31947 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFNP31947 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFNP31947 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFNP31947 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFNP31947 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFNP31947 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SFNP31947 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFNP31947 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFNP31947 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFNP31947 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFNP31947 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFNP31947 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFNP31947 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SFNP31947 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFNP31947 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFNP31947 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFNP31947 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFNP31947 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFNP31947 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFNP31947 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFNP31947 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFNP31947 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SFNP31947 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SFNP31947 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SFNP31947 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SFNP31947 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SFNP31947 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SFNP31947 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms