Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMBRP28336 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NMBRP28336 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NMBRP28336 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NMBRP28336 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NMBRP28336 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NMBRP28336 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NMBRP28336 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMBRP28336 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMBRP28336 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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