Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms