Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IL3RAP26951 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms