Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HMGB2P26583 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HMGB2P26583 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMGB2P26583 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms