Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms