Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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