Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXB4P17483 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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