Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA1P17302 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJA1P17302 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJA1P17302 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJA1P17302 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA1P17302 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA1P17302 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA1P17302 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA1P17302 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA1P17302 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA1P17302 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA1P17302 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA1P17302 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA1P17302 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA1P17302 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA1P17302 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA1P17302 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GJA1P17302 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms