Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms