Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms