Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms