Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TMEM225BP0DP42 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TMEM225BP0DP42 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TMEM225BP0DP42 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TMEM225BP0DP42 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TMEM225BP0DP42 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TMEM225BP0DP42 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms