Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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