Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

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Length 923 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAPGEF3O95398 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
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