Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX4O95219 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX4O95219 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX4O95219 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms